Use of a multiplex-polymerase chain reaction for detection of Salmonella and Chlamydophila psittaci from caged birds
No Thumbnail Available
Files
Date
2009
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
In this study, development of a multiplex-PCR (m-PCR) assay for identification of Salmonellosis and Psittacosis
in caged birds was aimed. DNAs extracted from Salmonella spp. strains from the collection of our department and Salmonella spp.
isolates from caged birds in addition to the extracted DNA samples belong to two different Chlamydophila psittaci clinical strains
(strain 6BC and a strain isolated from a parakeet), constituted the material of the study. A m-PCR assay was developed which use
iroBF and iroBR primers to specifically amplify 606 bp sequence of iroB gene of Salmonella spp. DNA in the same reaction mix and
with the same conditions, CpsiA and CpsiB primers were used to amplify 300 bp sequence of pmp gene of C. psittaci. The specificity
and the sensitivity of the assay were determined by using positive controls (Salmonella and Chlamydia DNA samples). We believe
that the newly developed m-PCR assay is a fast, reliable and an economic assay, which has the potential for direct identification of
Salmonella spp. and C. psittaci from the clinical samples.
Bu çalışmada, Salmonellosis ve Psittacosis’in tanısında kullanılmak üzere bir multipleks-polimeraz zincir reaksiyonu
(m-PZR) tekniği geliştirilmesi amaçlandı. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı suş koleksiyonunda
yer alan Salmonella suşları, kafes kuşu orijinli Salmonella izolatları ve bunlardan izole edilen DNA örnekleri dışında yurt dışından
sağlanan ve iki farklı Chlamydophila psittaci klinik suşundan izole edilmiş DNA örnekleri çalışma materyalini oluşturdu. Çalışmada,
Salmonella türlerinde iroB genini kodlayan sekansın 606 bp’lik porsiyonunu spesifik olarak amplifiye eden iroBF ve iroBR primer
çifti ile Chlamydophila psittaci’nin pmp genlerinin 300 bp’lik sekansını amplifiye eden CpsiA ve CpsiB primer çiftinin aynı
reaksiyon karışımı ve şartlarında çalışacağı bir m-PZR tekniği geliştirildi. Pozitif kontrol Chlamydophila psittaci DNA’larının
dışında, kendi laboratuvar izolatları ve suşlarından izole edilen DNA örnekleri kullanılarak tekniğin spesifite ve sensitivitesi de
belirlendi. Sonuç olarak, klinik materyallerden direkt tanı potansiyeli de bulunan tekniğin kafes kuşlarında Salmonella spp. ve C.
psittaci’nin tanısında hızlı, güvenilir ve ekonomik bir teknik olduğu düşünülmektedir.
Description
Keywords
Caged birds, identification, multiplex-PCR, Salmonella spp., Chlamydophila psittaci, kafes kuşları, tanı